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stat:rnaseq

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stat:rnaseq [2024/10/21 11:29] – [rMATS] inkitstat:rnaseq [2024/10/21 13:14] (当前版本) – [rMATS] inkit
行 101: 行 101:
   * A3SS(Alternative 3' Splice Site,可变 3' 剪接位点)   * A3SS(Alternative 3' Splice Site,可变 3' 剪接位点)
   * RI(Retained Intron,内含子保留)   * RI(Retained Intron,内含子保留)
 +SE (Skipped Exon), MXE (Mutually Exclusive Exons), A5SS (Alternative 5' Splice Site), A3SS (Alternative 3' Splice Site), RI (Retained Intron) 
 ===计数方法=== ===计数方法===
   * JC(Junction Counts):仅使用跨越剪接点的 reads 进行定量分析。提供更为精准的剪接定量,但可能会漏掉一些低覆盖的剪接事件。   * JC(Junction Counts):仅使用跨越剪接点的 reads 进行定量分析。提供更为精准的剪接定量,但可能会漏掉一些低覆盖的剪接事件。
stat/rnaseq.1729510144.txt.gz · 最后更改: 2024/10/21 11:29 由 inkit