stat:rnaseq
差别
这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。
| 两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版 | ||
| stat:rnaseq [2024/10/21 11:28] – [rMATS] inkit | stat:rnaseq [2024/10/21 13:14] (当前版本) – [rMATS] inkit | ||
|---|---|---|---|
| 行 101: | 行 101: | ||
| * A3SS（Alternative 3' Splice Site，可变 3' 剪接位点） | * A3SS（Alternative 3' Splice Site，可变 3' 剪接位点） | ||
| * RI（Retained Intron，内含子保留） | * RI（Retained Intron，内含子保留） | ||
| + | SE (Skipped Exon), MXE (Mutually Exclusive Exons), A5SS (Alternative 5' Splice Site), A3SS (Alternative 3' Splice Site), RI (Retained Intron) | ||
| ===计数方法=== | ===计数方法=== | ||
| * JC（Junction Counts）：仅使用跨越剪接点的 reads 进行定量分析。提供更为精准的剪接定量，但可能会漏掉一些低覆盖的剪接事件。 | * JC（Junction Counts）：仅使用跨越剪接点的 reads 进行定量分析。提供更为精准的剪接定量，但可能会漏掉一些低覆盖的剪接事件。 | ||
| * JCEC（Junction Counts and Exon Counts）：使用跨越剪接点和覆盖整个外显子的 reads 进行定量分析。能检测更多事件，但有时可能会引入额外的噪音。 | * JCEC（Junction Counts and Exon Counts）：使用跨越剪接点和覆盖整个外显子的 reads 进行定量分析。能检测更多事件，但有时可能会引入额外的噪音。 | ||
| + | 如果需要更精准的剪接事件识别，建议使用 JC。如果希望尽可能多地检测到所有的剪接事件，可以考虑 JCEC。 | ||
| ===txt=== | ===txt=== | ||
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stat/rnaseq.1729510128.txt.gz · 最后更改: 2024/10/21 11:28 由 inkit
