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stat:rnaseq:srasubmit

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stat:rnaseq:srasubmit [2024/04/04 23:38] inkitstat:rnaseq:srasubmit [2024/04/05 17:16] (当前版本) – [7 Sample Attributes] inkit
行 1: 行 1:
-====== 如何向SRA提交数据 ====== +====== SRA Submission ====== 
-===1 访问 [[https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/sra/]],建立新提交===+Visit [[https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/sra/]] 
 + 
 +=====0 Prepare==== 
 + Login to NIH website.\\ 
 +通过登录按钮登录到网站可以用一键登录,如果是新账号,会有引导。 
 + 
 +{{:stat:rnaseq:sra0login.png?500|}} 
 + 
 + 
 +=====1 New submission===== 
 + 
 +建立一个新提交
  
 {{:stat:rnaseq:sranewsubmission.png?500|}} {{:stat:rnaseq:sranewsubmission.png?500|}}
  
-===2 填写首页,页面可以建立小组,共同完善提交的数据===+=====2 submitter info & Create group to invite other member filling the form===== 
 +填写基本信息。这个页面可以建立group在group可以通过email邀请其他人共同成这个表格,分工以完成
  
 {{:stat:rnaseq:srapage1submitter.png?500|}} {{:stat:rnaseq:srapage1submitter.png?500|}}
 +
 +
 +=====3 Invite others =====
 +这个页面填写其他人的email。
 +
 +{{:stat:rnaseq:sra3groupinvites.png?500|}}
 +
 +=====4 general info=====
 +
 +
 +{{:stat:rnaseq:sra4p2generalinfo.png?500|}}
 +
 +=====5 porject info=====
 +
 +{{:stat:rnaseq:sra5p3projinfo.png?500|}}
 +
 +
 +=====6 Sample Type=====
 +
 +{{:stat:rnaseq:sra6p4sampletype.png?500|}}
 +
 +===== 7 Sample Attributes =====
 +**Follow the instructions in the table**
 +
 +填表规则:
 +  - Organism 必须来自 [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/biosample/docs/organism/]]
 +  - 标有相同符号的列至少要有一列有数据
 +  - 填写的数据除去name title几列,剩余其他列的每行信息不能完全相同,必须在某个地方有差异
 +  - date,日期格式要严格按照说明的格式,比如可以写 2022-01-01。
 +
 +{{:stat:rnaseq:sra7p5sampleattr.png?500|}}
 +
 +
 +=====8 SRA Metadata =====
 +
 +{{:stat:rnaseq:sra8psrameta.png?500|}}
 +
 +
 +===== 9 Upload File =====
 +
 +
 +{{:stat:rnaseq:sra9p7upload.png?500|}}
stat/rnaseq/srasubmit.1712273914.txt.gz · 最后更改: 2024/04/04 23:38 由 inkit